A Expedição Humboldt coordenada pelo Núcleo de Estudos Amazônicos do Centro de Estudos Avançados Multidisciplinares da Universidade de Brasília (NEAz / CEAM / UnB) em parceria com a Universidade Simon Bolivar, da Venezuela ocorreu entre 01 setembro e 03 novembro de 2000, quando se completaram 200 anos da viagem de Alexander von Humboldt aos rios Orinoco e Negro e ao canal do Cassiquiare. Durante 62 dias, ela percorreu 14 rios na Amazônia brasileira, no Amazonas venezuelano e na Guiana Francesa e reuniu 49 pesquisadores de nove instituições de ensino e pesquisa do Brasil, Venezuela, França e Estados Unidos, com o objetivo de produzir novos conhecimentos sobre a Amazônia, proteger a biodiversidade, defender o patrimônio natural, histórico e artístico, produzir material pedagógico, defender os direitos dos povos indígenas, das populações ribeirinhas e dos remanescentes de quilombos e estreitar relações científicas e culturais entre países amazônicos.
Partindo do delta do Orinoco, na Venezuela, a expedição inicialmente refez o percurso feito por Alexander Von Humboldt em 1799. Humboldt foi um dos maiores cientistas de seu tempo – amigo de Goethe, de Laplace e de Gay-Lussac, e colega do brasileiro José de Bonifácio de Andrada e Silva (o Patriarca da Independência) na Escola de Minas de Freiburg. Sendo então escolhido como patrono dessa expedição. Em companhia do botânico Aimé Bompland, Humboldt chegou à Venezuela em julho de 1799 e algum tempo depois saiu em busca do canal que une as bacias do Orinoco e do Amazonas.
Depois de ter estudado o Canal do Cassiquiare, Humboldt, já na fronteira do Brasil, não pôde prosseguir sua viagem pois as autoridades portuguesas da época negaram-lhe autorização. No 2º centenário da viagem de Humboldt pela Amazônia Venezuelana, a Universidade de Brasília (UnB) e a Universidade Simon Bolívar, por meio de seus cientistas e historiadores, concretizaram o percurso de Humboldt. Concluindo, assim, o trecho que ele não pode concluir há 200 anos.